Una parte del sintesi moderna della teoria evolutiva coinvolge la biologia della popolazione e, a un livello ancora più piccolo, la genetica della popolazione. Poiché l'evoluzione è misurata in unità all'interno delle popolazioni e solo le popolazioni possono evolversi e non gli individui, quindi la biologia della popolazione e la genetica della popolazione sono parti complesse della teoria di Evoluzione attraverso Selezione naturale.
quando Charles Darwin pubblicato per la prima volta le sue idee sull'evoluzione e la selezione naturale, il campo della genetica non era ancora stato scoperto. Dato che rintracciare alleli e genetica è una parte molto importante della biologia e della genetica delle popolazioni, Darwin non ha coperto completamente queste idee nei suoi libri. Ora, con più tecnologia e conoscenza sotto le nostre cinture, possiamo incorporare più biologia e genetica di popolazione nella teoria dell'evoluzione.
Un modo per farlo è attraverso la coalescenza degli alleli. I biologi della popolazione guardano al
pool genico e tutti gli alleli disponibili all'interno della popolazione. Quindi cercano di risalire all'origine di questi alleli nel tempo per vedere da dove sono iniziati. Gli alleli possono essere fatti risalire attraverso vari lignaggi su a filogenetico albero per vedere dove si uniscono o tornano insieme (un modo alternativo di vederlo è quando il alleli ramificato l'uno dall'altro). I tratti si fondono sempre in un punto chiamato il più recente antenato comune. Dopo il più recente antenato comune, gli alleli si sono separati e si sono evoluti in nuovi tratti e molto probabilmente le popolazioni hanno dato origine a nuove specie.The Coalescent Theory, molto simile Equilibrio di Hardy-Weinberg, ha alcune ipotesi che eliminano i cambiamenti negli alleli attraverso eventi casuali. La teoria coalescente presume che non vi sia flusso genetico casuale o deriva genetica degli alleli all'interno o all'esterno delle popolazioni, la selezione naturale è non lavora sulla popolazione selezionata per un determinato periodo di tempo e non vi è alcuna ricombinazione di alleli per formare nuovi o più complessi alleli. Se questo è vero, allora il più recente antenato comune può essere trovato per due diversi lignaggi di specie simili. Se uno dei precedenti è in gioco, allora ci sono molti ostacoli che devono essere superati prima che il più recente antenato comune possa essere individuato per quelle specie.
Man mano che la tecnologia e la comprensione della teoria coalescente diventano più facilmente disponibili, il modello matematico che la accompagna è stato modificato. Queste modifiche al modello matematico consentono alcune delle problematiche precedentemente inibitive e complesse con la biologia della popolazione e la genetica della popolazione è stata curata e tutti i tipi di popolazioni possono quindi essere utilizzati ed esaminati usando il teoria.