TBE e TAE sono usati come tamponi nella biologia molecolare, principalmente per elettroforesi di acidi nucleici. I tamponi Tris sono usati in condizioni di pH leggermente basiche, come per l'elettroforesi del DNA, perché questo mantiene il DNA solubile nella soluzione e deprotonato in modo da essere attratto dall'elettrodo positivo e migrare attraverso a gel. EDTA è un ingrediente nella soluzione perché questo comune agente chelante protegge gli acidi nucleici dalla degradazione degli enzimi. L'EDTA chelera cationi bivalenti che sono cofattori per nucleasi che possono contaminare il campione. Tuttavia, poiché il catione di magnesio è un cofattore della DNA polimerasi e degli enzimi di restrizione, la concentrazione di EDTA viene mantenuta volutamente bassa (concentrazione di circa 1 mM).
Non è necessario sterilizzare la soluzione. Sebbene le precipitazioni possano verificarsi dopo un lasso di tempo, la soluzione madre è ancora utilizzabile. È possibile regolare il pH utilizzando un pHmetro e un'aggiunta goccia a goccia di concentrato
acido cloridrico (HCl). Va bene conservare il tampone TBE a temperatura ambiente, anche se potresti voler filtrare la soluzione madre attraverso un filtro da 0,22 micron per rimuovere le particelle che favorirebbero la precipitazione.L'uso accidentale di una soluzione madre 5X o 10X produrrà scarsi risultati perché verrà generata la maggior quantità di calore. Oltre a fornire una risoluzione scadente, il campione potrebbe essere danneggiato.
Sebbene TBE e TAE siano comuni buffer di elettroforesi, ci sono altre opzioni per soluzioni conduttive a bassa molarità, tra cui tampone borato di litio e tampone borato di sodio. Il problema con TBE e TAE è che i buffer basati su Tris limitano il campo elettrico che può essere utilizzato in elettroforesi perché troppa carica provoca una temperatura di fuga.